PSMC/MSMC ile popülasyon büyüklüğü tahmini — simüle edilmiş eğriler

Popülasyon büyüklüğü eğrileri: Afrika en yüksek, Yerli Amerikan en düşük Nₑ gösterir.
Yatay eksen: bin yıl önce (log ölçek) | Dikey eksen: etkin popülasyon büyüklüğü (Nₑ × 10³). Eğriler öğretim için elle çizilmiştir; yayımlanmış bir analizin sonucu değildir.
Afrika (Yoruba) Avrupa (Fransız) Doğu Asya (Han) Yerli Amerikan
Nasıl okunur: Eğrilerin eski dönemde üst üste binmesi, nüfusların henüz ayrışmadığı dönemi gösterir (Li ve Durbin 2011'de yaklaşık 150 bin yıldan eskisi). Afrika dışı eğrilerin düşmesi, yaklaşık 60–10 bin yıl önceki darboğazı temsil eder; Afrika nüfusları da darboğaz yaşadı, ama daha hafifini. Dikkat: nüfus yapısı (alt gruplar arasında sınırlı göç) nüfus büyüklüğü hiç değişmese bile benzer bir düşüş üretebilir (Mazet ve ark. 2016). 20 bin yıldan yakın bölüm PSMC için güvenilir değildir.
ÖzellikPSMC (Li & Durbin 2011)MSMC (Schiffels & Durbin 2014)
GirdiTek bir diploid genom2-8 haploid dizi (1-4 birey)
Zaman çözünürlüğü~20.000 – 3.000.000 yıl~2.000 yıl öncesine kadar daha iyi
Güçlü yönTek bir genom yeterYakın geçmiş çözünürlüğü yüksek
Zayıf yönYakın geçmişi göremez (<20K yıl)Fazlanmış (phased) veri gerekir
Ek yetenek—Popülasyon ayrışma zamanı hesaplar
Veri kalitesiYüksek kapsamlı genom; düşük kapsamlı antik genomlara uygun değilYüksek kalite + fazlama gerekli