Doğal seçilim: genomda neyin izi kalır?
Bir varyant, taşıyanına hayatta kalma ya da üreme avantajı sağlıyorsa kuşaklar içinde yaygınlaşır. Bu süreç genomda iz bırakır: çevresindeki DNA parçası olağandışı uzun ve tek biçimli kalır. Bu sayfa o izlerin nasıl okunduğunu, hangi örneklerin sağlam olduğunu ve “Türklerde şu gen seçildi” cümlelerinin ne kadarının veriye dayandığını anlatır.
Türkiye için seçilim verisi çok az. Bu sayfadaki sekiz klasik örnekten yalnız biri — Ailesel Akdeniz Ateşi'ne yol açan MEFV mutasyonları — için Türkiye örnekleminde yapılmış hakemli bir seçilim çalışması var[1]. Öteki yedisi için Türkiye'de yalnız sıklık ölçümleri vardır; seçilim taraması yoktur.
Türk dilli halklar üzerine ise birkaç tarama var (Sincan Kırgızları, Uygurlar, Sarı Uygurlar, Sibirya’nın yerli halkları). Bunların çoğu bir genin seçildiğini değil, karışım sonrası soy oranlarının nerede beklenenden saptığını gösterir.
1. Seçilim nasıl tespit edilir?
Üç ana yaklaşım var ve her biri farklı bir zaman dilimini görür:
- Uzun haplotip testleri (iHS). Henüz sabitlenmemiş bir varyant hızla yaygınlaştıysa, çevresindeki DNA rekombinasyonla parçalanmaya fırsat bulamamıştır; varyant uzun ve tek biçimli bir parçanın içinde taşınır. Bu test çok yakın tarihli seçilimi yakalar[2].
- Nüfuslar arası karşılaştırma (XP-EHH). Bir nüfusta neredeyse sabitlenmiş, ötekinde nadir kalmış varyantları bulur. Aynı taramada Avrupa'da SLC24A5, Asya'da EDAR öne çıkar[3].
- Antik DNA zaman serisi. Varyantın sıklığının yüzyıllar içinde nasıl değiştiğini doğrudan ölçer. En büyük çalışma 15.836 Batı Avrasyalıda yüzlerce alelde yönlü seçilim buldu[4].
2. Seçilim gibi görünen ama olmayan şeyler
Bu alanın en önemli dersi: bir varyantın sıklığının değişmesi seçilim demek değildir.
- Demografi seçilimi taklit eder. Darboğaz yaşamış nüfuslarda tarama yöntemlerinin yanlış keşif oranı yükselir; gerçek hedeflerin çoğu zaman çoğu da kaçırılır[5]. 2009'da genom çapı seçilim haritaları “düşük çözünürlüklü, eksik ve hataya açık” diye nitelendi[6].
- Karışım seçilimi taklit eder. Önceki beş taramada (dördü antik DNA’ya dayanır) “genom çapında anlamlı” bulunan 38 HLA dışı lokustan 20'si en büyük veri setinde tekrarlanmadı; çoğunun nedeni denetlenmemiş nüfus yapısıydı[4].
- Bütün bir literatür düzeltilebilir. Boy için bildirilen güçlü seçilim sinyallerinin, büyük ölçüde genom çapı ilişkilendirme çalışmalarındaki düzeltilmemiş nüfus katmanlaşmasından kaynaklandığı sonradan gösterildi[7, 8].
- Yüksek sıklık tek başına kanıt değildir. Bu ders Y kromozomu için de geçerli: çok yaygın baba hatları, tarihsel bir kişiye ya da seçilime bağlanmadan da açıklanabilir[9]. Ayrıntı: Cengiz Han'ın DNA'sı bulundu mu?
3. Sekiz klasik örnek
| Gen | Ne değişti | Seçilimin kanıtı | Türkiye verisi |
|---|---|---|---|
| LCT | Yetişkinlikte laktoz sindirimi | Genomdaki en güçlü yakın dönem sinyallerinden; son 5.000–10.000 yıl[10]. Antik DNA'da alelin bilinen ilk taşıyıcısı Orta Avrupa'da, MÖ ~2300[11] | 98 kişide alel sıklığı 0,03; 126 kişide fenotip %30[12] |
| MEFV | Ailesel Akdeniz Ateşi; vebaya karşı direnç | 2.313 Türk bireyinde uzun haplotip izi; mutant pyrin Y. pestis'e karşı koruyucu[1] | Seçilim çalışması var (aynı yayın). Taşıyıcılık: sağlıklı gönüllülerde %20[13]; önceki verilerin hastane tabanlı olduğunu vurgulayan nüfus tabanlı 7 bölgelik saha çalışmasında %14,8[14] |
| EDAR | Saç kalınlığı, ter ve meme bezleri | Fare deneyiyle işlev gösterildi; alelin kökeni için ~30.000 yıl önce Orta Çin önerildi[15] — ama aynı alel Mezolitik İsveç avcı-toplayıcılarında da bulundu[11] | Yok. Türk dilli halklardan yalnız Uygurlar için sıklık var (0,44)[16] |
| EPAS1 | Yüksek rakıma uyum | Tibetlilerde, Denisova benzeri insanlardan geçen bir haplotip[17] | Yok. Sincan Kırgızlarında bu gende seçilim sinyali bulunmadı[18] |
| SLC24A5 ve OCA2/HERC2 | Ten ve göz rengi | SLC24A5'in açık ten aleli Anadolu Neolitik çiftçilerinde zaten sabitti; Avrupa'daki hızlı yükseliş büyük ölçüde göçle oldu[11] | Yok |
| FADS1/2 | Yağ asidi metabolizması | Avrupa'da tarım öncesinde ve sonrasında aynı varyantlarda, zıt aleller lehine seçilim[19]; Grönland İnuitlerinde aynı küme güçlü seçilim altında[20] | Yok. Türk dilli halklardan Sarı Uygurlarda güçlü sinyal[21] |
| HLA | Bağışıklık sisteminin “tanıma” genleri | Çeşitliliğin seçilimle korunduğu güçlü biçimde desteklenir[22]; ama antik DNA sinyali sürüklenmeyle de açıklanabilir[11] | Yok |
| Sıtma direnci genleri (G6PD, alfa⁺-talasemi, HbC) | Sıtmaya karşı direnç | Sıtma, insan genomunun yakın tarihindeki en güçlü seçilim kuvveti olarak anılır; G6PD eksikliği, alfa⁺-talasemi ve HbC’nin korunma sağladığı epidemiyolojik olarak doğrulandı[23] | Beta-talasemi taşıyıcılığı için aktarılan Türkiye ortalaması ~%2,1[24]; G6PD eksikliği bölgeye göre %0,25–18[25]. Seçilimi Türkiye'de sınayan çalışma yok |
MEFV: Türkiye'deki tek doğrudan örnek
Ailesel Akdeniz Ateşi'ne yol açan mutasyonlar Türkiye'de yakın tarihli pozitif seçilim izi taşır. İki hastalık yapıcı varyant birbirinden bağımsız olarak 1.800 yıldan uzun süre önce ortaya çıkmıştır; mutant protein vebaya yol açan bakterinin bir bileşeniyle daha zayıf etkileşir ve bu mutasyonu taşıyan fareler vebaya karşı daha uzun yaşar[1].
Üç önemli nüans:
- Taşıyıcıların ortak ataları büyük olasılıkla bilinen veba salgınlarından önce Orta Doğu'da yaşadı; yani bu seçilimin Türklerin Anadolu'ya gelişiyle bir ilgisi yoktur[1].
- Türkiye'de en yaygın varyant olan E148Q, yüksek sıklığına rağmen seçilim izi göstermez[1]. “Taşıyıcıların hepsi veba seçiliminin ürünüdür” denemez.
- Akraba evliliği taşıyıcı oranını değil, iki kopyayı birden taşıyanların — yani hastaların — oranını artırır. Türkiye'deki yüksek akraba evliliği oranı nadir varyantlarda homozigotluk fazlası üretir[26].
4. Türkiye ve Türk dilli halklar için ne biliniyor?
Şaşırtıcı ama önemli bir sonuç: Türkiye'nin genetik yapısını inceleyen büyük çalışmaların hiçbiri bir seçilim taraması yapmaz. Türk dilli halklar üzerine en geniş genom çalışmasında seçilim analizi yoktur[27]; Türkiye'nin en büyük genom veri setinde de yoktur — orada akraba evliliği ve homozigotluk incelenir[26]. Antik DNA seçilim çalışmalarında Anadolu Neolitik bireyleri bir kaynak nüfus olarak yer alır, ama Anadolu'nun kendi zaman serisi çıkarılmamıştır[11, 4].
Türk dilli halklar için ise birkaç hakemli tarama var:
- Sincan Kırgızları: klasik yüksek rakım genlerinde seçilim yok; laktaz geninde süpürme izi yok — yazarlar bunu karışım sonrası gevşemeye ve fermente süt ürünlerine “muhtemelen” bağlar[18].
- Uygurlar: karışım sonrası uyum izleri metabolizma, sindirim ve bağışıklık genlerinde; bazı genlerde ise seçilimin “gevşediği” görülür[28].
- Sarı Uygurlar: FADS bölgesinde güçlü seçilim[21].
- Sibirya’nın yerli halkları: soğuğa uyum taramasında en güçlü sinyal Türk dilli gruplarda değil, Kuzeydoğu Sibirya'nın Çukçi ve Koryak gibi halklarındadır[29].
Sitenin eski sürümünde “Anadolu seçilim zaman çizelgesi” ve “Türk halklarında büyük seçilim sinyalleri” tabloları vardı. Bunlar Avrupa antik DNA bulgularının ve tek tek gen çalışmalarının Anadolu'ya ya da Türk halklarına aktarılmasıyla kurulmuştu; dayandıkları kaynakların bir kısmı yanlış künyeyle, bir kısmı da kaynağın söylemediği sonuçlarla veriliyordu. Ayrıntı: Düzeltmeler.
5. Bunu söylemek doğru değil
- “Türklerde laktoz toleransı Orta Asya'dan gelen bir seçilimdir.” Türkiye'de bilinen kalıcılık alellerinin sıklığı 0,03, ölçülen fenotip ise %30’dur; yazarlar bilinen alellerin bu bölgedeki fenotipi açıklamadığını söyler[12]. Kazaklarda −13910*T sıklığı %30’dur ve Kuzey Avrupa’dan çok düşüktür[30]. Hiçbiri Orta Asya’dan gelen bir seçilimin kanıtı değildir.
- “Laktoz toleransı Anadolu Neolitik'inde başladı.” Antik DNA'da alelin bilinen ilk taşıyıcısı Orta Avrupa'da bir Çan Biçimli Kap bireyidir (MÖ ~2300–2200)[11].
- “EDAR aleli bir kişinin Türk ata payını gösterir.” Tek bir lokus soy payını ölçemez; üstelik seçilim altındaki bir lokus nötr bir belirteç de değildir.
- “Kırgızlar yüksek rakıma Tibetliler gibi genetik olarak uyum sağladı.” Sincan Kırgızlarında EPAS1 ve öteki klasik genlerde sinyal bulunmadı[18].
- “Ailesel Akdeniz Ateşi Türklerin Anadolu'ya gelişiyle yayıldı.” Mutasyonların ortak ataları bölgede çok daha önce yaşadı[1].
- “Bir genin sıklığı arttıysa seçilmiştir.” Göç ve karışım da sıklığı değiştirir; SLC24A5'in Avrupa'daki yükselişi bunun örneğidir[11].
Açık sorular
- Anadolu'nun Neolitik'ten bugüne antik DNA zaman serisi çıkarılırsa, hangi alellerde yönlü değişim görülecek?
- Türkiye'nin büyük genom veri setlerinde bir seçilim taraması yapılacak mı?
- MEFV dışında, Türkiye'de sıklığı yüksek olan hastalık varyantlarından hangileri seçilim izi taşıyor?
Kaynaklar
- Park, Yong Hwan vd. «Ancient familial Mediterranean fever mutations in human pyrin and resistance to Yersinia pestis.» Nature Immunology 21, sayı 8 (2020): 857–867. doi:10.1038/s41590-020-0705-6 Hakemli / akademik
- Voight, Benjamin F. vd. «A map of recent positive selection in the human genome.» PLoS Biology 4, sayı 3 (2006): e72. doi:10.1371/journal.pbio.0040072 Hakemli / akademik
- Sabeti, Pardis C. vd. «Genome-wide detection and characterization of positive selection in human populations.» Nature 449, sayı 7164 (2007): 913–918. doi:10.1038/nature06250 Hakemli / akademik
- Akbari, Ali vd. «Ancient DNA reveals pervasive directional selection across West Eurasia.» Nature 654, sayı 8118 (2026): 419–428. doi:10.1038/s41586-026-10358-1 Hakemli / akademik
- Teshima, Kosuke M., Graham Coop ve Molly Przeworski. «How reliable are empirical genomic scans for selective sweeps?» Genome Research 16, sayı 6 (2006): 702–712. doi:10.1101/gr.5105206 Hakemli / akademik
- Akey, Joshua M. «Constructing genomic maps of positive selection in humans: where do we go from here?» Genome Research 19, sayı 5 (2009): 711–722. doi:10.1101/gr.086652.108 Hakemli / akademik
- Berg, Jeremy J. vd. «Reduced signal for polygenic adaptation of height in UK Biobank.» eLife 8 (2019): e39725. doi:10.7554/eLife.39725 Hakemli / akademik
- Sohail, Mashaal vd. «Polygenic adaptation on height is overestimated due to uncorrected stratification in genome-wide association studies.» eLife 8 (2019): e39702. doi:10.7554/eLife.39702 Hakemli / akademik
- Guillot, Elsa G. ve Murray P. Cox. «High frequency haplotypes are expected events, not historical figures.» F1000Research 4 (2015, 2. sürüm 2016): 666. doi:10.12688/f1000research.7023.2 Hakemli / akademik
- Bersaglieri, Todd vd. «Genetic signatures of strong recent positive selection at the lactase gene.» American Journal of Human Genetics 74, sayı 6 (2004): 1111–1120. doi:10.1086/421051 Hakemli / akademik
- Mathieson, Iain vd. «Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians.» Nature 528, sayı 7583 (2015): 499–503. doi:10.1038/nature16152 Hakemli / akademik
- Itan, Yuval vd. «A worldwide correlation of lactase persistence phenotype and genotypes.» BMC Evolutionary Biology 10 (2010): 36. doi:10.1186/1471-2148-10-36 Hakemli / akademik
- Yılmaz, Engin vd. «Mutation frequency of Familial Mediterranean Fever and evidence for a high carrier rate in the Turkish population.» European Journal of Human Genetics 9, sayı 7 (2001): 553–555. doi:10.1038/sj.ejhg.5200674 Hakemli / akademik
- Söylemezoğlu, Oğuz vd. «Familial Mediterranean fever gene mutation frequencies in a sample Turkish population.» Clinical and Experimental Rheumatology 34, sayı 6 Ek 102 (2016): 97–100. PMID 27791953 (DOI yok). Hakemli / akademik
- Kamberov, Yana G. vd. «Modeling recent human evolution in mice by expression of a selected EDAR variant.» Cell 152, sayı 4 (2013): 691–702. doi:10.1016/j.cell.2013.01.016 Hakemli / akademik
- Bryk, Jarosław vd. «Positive selection in East Asians for an EDAR allele that enhances NF-κB activation.» PLoS ONE 3, sayı 5 (2008): e2209. doi:10.1371/journal.pone.0002209 Hakemli / akademik
- Huerta-Sánchez, Emilia vd. «Altitude adaptation in Tibetans caused by introgression of Denisovan-like DNA.» Nature 512, sayı 7513 (2014): 194–197. doi:10.1038/nature13408 Hakemli / akademik
- Chen, Shuanghui vd. «Tracing the genetic heritage of the Kirgiz people: dual-wave admixture and ancestry-biased adaptation.» Molecular Biology and Evolution 42, sayı 8 (2025): msaf196. doi:10.1093/molbev/msaf196 Hakemli / akademik
- Ye, Kaixiong vd. «Dietary adaptation of FADS genes in Europe varied across time and geography.» Nature Ecology & Evolution 1, sayı 7 (2017): 0167. doi:10.1038/s41559-017-0167 Hakemli / akademik
- Fumagalli, Matteo vd. «Greenlandic Inuit show genetic signatures of diet and climate adaptation.» Science 349, sayı 6254 (2015): 1343–1347. doi:10.1126/science.aab2319 Hakemli / akademik
- Yu, Siyong vd. «Divergent Eurasian ancestry and local adaptation shape the genetic landscapes of the Yugur and Uyghur.» Briefings in Bioinformatics 27, sayı 1 (2026): bbag041. doi:10.1093/bib/bbag041 Hakemli / akademik
- Meyer, Diogo ve Glenys Thomson. «How selection shapes variation of the human major histocompatibility complex: a review.» Annals of Human Genetics 65, sayı 1 (2001): 1–26. doi:10.1046/j.1469-1809.2001.6510001.x Hakemli / akademik
- Kwiatkowski, Dominic P. «How malaria has affected the human genome and what human genetics can teach us about malaria.» American Journal of Human Genetics 77, sayı 2 (2005): 171–192. doi:10.1086/432519 Hakemli / akademik
- Güler, Ekrem vd. «Premarital screening test results for β-thalassemia and sickle cell anemia trait in east Mediterranean region of Turkey.» Pediatric Hematology and Oncology 27, sayı 8 (2010): 608–613. doi:10.3109/08880018.2010.503772 Hakemli / akademik
- Albayrak, Canan ve Davut Albayrak. «Red cell glucose 6-phosphate dehydrogenase deficiency in the northern region of Turkey: is G6PD deficiency exclusively a male disease?» Pediatric Hematology and Oncology 32, sayı 2 (2015): 85–91. doi:10.3109/08880018.2014.940074 Hakemli / akademik
- Kars, M. Ece vd. «The genetic structure of the Turkish population reveals high levels of variation and admixture.» PNAS 118, sayı 36 (2021): e2026076118. doi:10.1073/pnas.2026076118 Hakemli / akademik
- Yunusbayev, Bayazit vd. «The genetic legacy of the expansion of Turkic-speaking nomads across Eurasia.» PLOS Genetics 11, sayı 4 (2015): e1005068. doi:10.1371/journal.pgen.1005068 Hakemli / akademik
- Pan, Yuwen vd. «Genomic diversity and post-admixture adaptation in the Uyghurs.» National Science Review 9, sayı 3 (2022): nwab124. doi:10.1093/nsr/nwab124 Hakemli / akademik
- Cardona, Alexia vd. «Genome-wide analysis of cold adaptation in indigenous Siberian populations.» PLoS ONE 9, sayı 5 (2014): e98076. doi:10.1371/journal.pone.0098076 Hakemli / akademik
- Heyer, Evelyne vd. «Lactase persistence in Central Asia: phenotype, genotype, and evolution.» Human Biology 83, sayı 3 (2011): 379–392. doi:10.3378/027.083.0304 Hakemli / akademik
turk.kim. “Doğal seçilim: genomda neyin izi kalır?” Temel kavram, 22 Ekim 2026. https://turk.kim/dogal_secilim.html